基本上有5个区别。
一、 企业类型的区别
我国公司类型有两种：有限责任公司（简称有限公司）、股份有限公司。
自然人和法人股东区别在企业类型细分中有更多体现。
以有限责任公司举例：
如果有限公司股东全部为自然人（暂不考虑涉及外商的自然人情况），有限责任公司后加注自然人投资或控股；若股东中包含自然人和法人，则加注其他有限责任；纯法人股东的，可能后边加注法人控股；若以国有资本为主，则可能加注国有控股。
这是一人独资。
这是两个以上的自然人投资。
这是自然人和企业法人投资。
二、 企业性质
这个在统计等其他部门进行填表或报送数据的时候会出现企业的性质，一般的有国有、集体、联营、合资、外商独资、私营企业等诸多选择项。
三、 股东背景的区别
企业介绍的时候，一般会介绍股东背景。
受众者一般青睐国有、外资、大企业股东背景，当然自然人投资的，比如几个马老师投资的，可能垂青有加了，无论青睐还是垂青，无他，有钱而已。
另外，在公司资本运作公开上市的时候，某会会对股东进行穿透，一直穿透到底。穿透到最终的投资人，或者是自然人，或者是国资委。
四、 再投资的区别
如果有限责任公司仅一个自然人股东，公司法规定一个自然人只能成立一个一人有限公司。普通有限公司，股东可成立多个有限公司。
另外，一人有限责任公司年报时需要进行审计，提供审计报告。而普通有限责任公司若无政府部门或行业要求，一般不用。
五、 企业分红的区别
自然人股东取得的投资企业的股息或分红，按“利息、股息、红利”所得，被投资企业扣缴其20%的个人所得税。
法人股东取得的股息、分红等投资收益，不需要缴纳企业所得税。
关于股东分红区别的其他内容，参考头条朋友《税收视点》的回答即可。
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